J. Horský, Noetika kulturních věd Maxe Webera a české dějepisectví, Albis international Ústí nad Labem 1994, stran 54, ISBN 80-900838-70.

J. Horský společně s M. Seligovou, Rodina našich předků, Lidové Noviny Praha 1996, stran 143, ISBN 80-7106-195-6.

Jan Horský (vyd.), Kulturní a sociální skutečnost v dějezpytném myšlení. Příspěvky k dějinám českého dějepisectví doby Gollovy školy, Albis international Ústí n. L. 1999, stran 462. ISBN 80-86067-42-4. (Text J. HOrského je zde na s. 5-86, 119-203, 248-270, 317-347 a 386-460. - Srborník je výstupem z projektu GAČR 404/96/1014.)

J. Horský spol. s K. Kaiserovou, Chancen der Demokratie in der Tschechoslowakei, in: Beiträge zur historischen Sozialkunde XXI, Verein für Geschichte und Sozialkunde Wien 1991, s. 119-122. ISSN není uvedeno.

J. Horský, Die "Idealtypen" Max Webers und die tschechische Geschichtsschreibung, in: Österreichische Zeitschrift für Geschichtswissenschaften IV, Verlag für Gesellschaftskritik Wien 1993, s. 642-650, ISSN 1016-765 X.

J. Horský, Fragen der Geschichte der Astronomie in der zweiten Hälfte des 16. Jahrhunderts in der tschechischen Historiographie, in: Später Humanismus in der Krone Böhmen 1570 - 1620. Studien zum Humanismus in den böhmischen Ländern IV., Herausgegeben von H.-B. Harder und H. Rothe, Dresden University Press 1998, s.243-253, ISBN 3-931828-59-X

J. Horský, Pojem renesance a dějiny přírodních věd, in: Sborník k padesátinám Zdeňka Neubauera, Centrum pro teoretické studie Univerzity Karlovy Praha 1992, s.45-47.

J. Horský, Max Weber a česká historiografie, in: Dějiny a současnost 3/1992, s.2 - 5, ISSN 0418-5129.

J. Horský, Příspěvek ke studiu venkovské poddanské čeledi v 16.-18.století (panství Třeboň - sonda), in: Archivní časopis, roč.43, 1993, č.3, s.145-166, ISSN 0004-0303.

J. Horský spol. s E. Maurem, Die Familie, Familienstrukturen und Typologie der Familien in der böhmischen Historiographie, in: Historická demografie 17, vyd.Sociologický ústav AV ČR, Praha 1993, s.7-35, ISSN 0323-0937.

J. Horský, Ältere Diskussion über die Zadruga und die Familienbesitzgemeinschaft in Böhmen und das heutige Studium der Familienstrukturen und -Typen, in: Historická demografie 17, vyd. Sociologický ústav AV ČR, Praha 1993, s. 37-51, ISSN 0323-0937.

J. Horský spol. s M. Sládkem, Rodinné, sociální a demografické poměry v poddanských vsích na panství Třeboň v letech 1586 a 1651, in: Historická demografie 17, vyd. Sociologický ústav AV ČR, Praha 1993, s. 71-110, ISSN 0323-0937.

J. Horský, Historická antropologie (Úvahy a poznámky na okraj mezinárodního kursu, konaného v Otzenhausenu ve dnech 27.2. - 15.3.1993), in: Historická demografie 17, vyd.Sociologický ústav AV ČR, Praha 1993, s. 241-270, ISSN 0323-0937.

J. Horský, Příspěvek ke studiu rodinných struktur v Čechách v 16. století (panství Třeboň - sonda), in: Jihočeský sborník historický LXII, 1993, s. 50-57, ISBN 80-900155-57.

J. Horský spol. s D. Štefanovou, Rekatolizace a rodinné, sociální a kulturní životní světy. (panství Frýdlant - sonda do Soupisu podle víry z roku 1651), in: Rekatolizace v českých zemích (Sborník příspěvků z konference v Jičíně dne 10. září 1993), Pardubice 1995 (vydal:Městský úřad Jičín ve spolupráci s Pekařovou společností Českého ráje Turnov a Historický klub - pobočka Pardubice, ISBN není uvedeno), s. 131-144.

Jan Horský, Historická demografie a nové metodické pohledy na sociální dějiny, in: Historická demografie XIX, Sociologický ústav AV ČR praha 1995, s. 135-153, ISSN 0323-0937.

J. Horský, Kulturwerte im deutschen und tschechischen Denken über die Geschichte, in: Die Böhmischen Ländern in der deutschen Geschichtssreibung seit dem Jahre 1848, Teil I., Acta Universitatis Purkynianae, Slavogermanica III, 1996, Ústí n. L. 1996, s. 9-29, ISBN 80-90 1761-6.X

J. Horský, Studium historického utváření rodiny v 16. až 18. století, in: Demografie. Revue pro výzkum populačního vývoje XXXVIII, 1996, s. 165-172. ISSN OO11-8265. Reg.zn. F 4781.

J. Horský, Einleitung, in: Historická demografie XX, Sociologický ústav AV ČR Praha 1996, s. 5-8, ISSN O323-0937.

J. Horský společně s I. Sedláčkovou a M. Seligovou, Ein einheitliches "altes demographisches Regime" oder die Bindung eines demographischen Verhaltens zu "Ökotypen", in: Historická demografie XX, Sociologický ústav AV ČR Praha 1996, s. 57-91, ISSN 0323-0937.

J. Horský, Tématika ženy v německé historicko-antropologické literatuře, in: Žena v dějinách Prahy. Sborník příspěvků z konference Archivu hl.m. Prahy a Nadace pro gender studies 1993, Documenta Pragensia XIII, Praha 1996, s.31-40. ISSN O231-7443.

J. Horský, Bedřich Mendl a noetika Maxe Webera, in: Bedřich Mendl profesor hospodářských dějin Univerzity Karlovy, 1892-1992, Velké osobnosti filozofické fakulty Univerzity Karlovy, Acta Universitatis Carolinae, Phil. et His. 4 - 1994, Praha 1997, s. 71-78, ISBN 80-7184-3040, ISSN 0567-8293.

J. Horský, Memoiren als historische Quellen für die Geschichte unserer Zeit, předmluva ke knize G. Eckelt, Wo ist mein Heim, mein Vaterland, Albis international Ústí nad Labem 1997, s.7-13, ISBN 80-86067-04-1.

J. Horský, Problém "symbolu" a "smyslu". Max Weber a dějezpytná práce, in: Vindemia. Sborník k 60. narozeninám Ivana Martinovského, Ústí n. L. 1997, 147-160, ISBN 80-86067-14-9.

J. Horský, K životnímu jubleu profesora Eduarda Maura, in: Historická demografie 21, vyd.Sociologický ústav AV ČR, Praha 1997, s.7-22, ISSN 0323-0937.

J. Horský, Memoárová literatura jako historický pramen k dějinám 20. století, in: Gerda Eckelt, Kde domov můj, Albis international Ústí n. L. 1998, s. 217-227, ISBN 80-86069-27-7.

Jan Horský, Racionalita dějinného jednání. Podněty Weberovy sociologie pro dějezpytné bádání, in: Soudobé dějiny VI, 1999, č. 1, s. 71-90, ISSN 1210-7050. (Článek je výstupem z projektu GAČR 404/96/1014.)

Jan Horský, "Mystika" a "magie". Úvaha o možnostech uplatnění kulturně dějinné klasifikace v dějezpytné práci, in: Lidé města, revue pro etnologii, antropologii a etologii komunikace, 1999, č.2, s.5-22, ISSN 1212-8112.

Jan Horský, Příspěvek k diskusi o luterství v Čechách v 16. a na počátku 17, století. (Několik poznámek k článkům Ludomíra Kocourka), in: Ústecký sborník historický, Ústí nad Labem 2000, s.224-235, ISBN 80-902241-7-2.

J. Horský spolu s: M. Seligová, P. Taněv, Myslet vesmír, in: Reflec. CS Společenský týdeník, ročník XI, 2000, č. 48, s. 84-87, ISSN není uvedeno.

Jan Horský, Studium rodinných struktur v raném novověku v českém prostředí (Přehled bádání za uplynulých 10 let), in: Česko-francouzský dialog o dějinách evropské rodiny, Cahiers du CeFReS, No. 22, Praha únor 2001, s. 33-52, ISBN 80-86311-05-8.

Jan Horský, O smyslu dějepisu aneb braňme se faktografům, in: Dějiny a současnost. Kulturně historická revue, roč. 28, 2001, č. 5, s. 2-4, ISSM 0418-5129.

Jan Horský, Moderní věda, rosenkruciánské myšlení a čeští evangelící. Několik poznámek k českému vydání knihy Frances A. Yatesové, in: Dějiny vědy a techniky XXXIV, 2001, s. 169-184, ISSN 0300-4414.

Jan Horský spolu s Markétou Seligovou, Kdy ztratil svět svůj tvar? aneb tisíciletý vliv anglické kosmologické tradice, in: Dějiny a současnost. Kulturně historická revue XXIV, 2002, č. 1, s. 1-8, ISSN 0418-5129.

Jan Horský, Teorie chaosu - nový "všelék" na bolesti dějezpytu? in: Dějiny a současnost. Kulturně historická revue XXIV, 2002, č. 5, s. 33-35, ISSN 0418-5129.

Jan Horský, Historik a duchovní entity, (v tisku) text referátu z konference: "Srdce Ježišovo, teologie - symbol - dějiny", pořádané Historickým ústavem AV ČR a Centrem pro církevní dějiny ve Vranově u Brna 30. 1. 2002, 19 tiskových stran

Jan Horský společně s Evou Pavlíkovou, Pojmoslovný aparát českého dějepisectví mezi "francouzským" a "německým" stylem dějezpytného myšlení, (v tisku) text referátu "Francouzská inspirace pro společenské vědy v českých zemích (60. leta 20. století)", pořádané Ústavem pro soudobé dějiny AV ČR a UK dne 21. 10. 20002. 30 normostran.

Jan Horský, "Duch doby" v českém dějepisectví a francouzský dějepis mentalit, (v tisku) text referátu z konference "Dějiny mentalit a jejich recepce v českém prostředí" pořádané VCDV při Ústavu pro soudobé dějiny AV ČR 30. 10. 2002, 28 normostran.

J. Horský, heslo: Antropologie historická, in: Velký sociologický slovník, Universita Karlova, Praha 1996, ISBN 80-7184-164-1, s.93

J. Horský, heslo: Poddanství, in: Velký sociologický slovník, Universita Karlova, Praha 1996, ISBN 80-7184-164-1, s.777,778

J. Horský, heslo: Nevolnictví, in: Velký sociologický slovník, Universita Karlova, Praha 1996, ISBN 80-7184-164-1, s.686

J. Horský, heslo: Otroctví, in: Velký sociologický slovník, Universita Karlova, Praha 1996, ISBN 80-7184-164-1, s. 745-746

J. Horský, heslo: Občina, in: Velký sociologický slovník, Universita Karlova, Praha 1996, ISBN 80-7184-164-1, s. 698-699

J. Horský, heslo: Revoluce buržoasní, in: Velký sociologický slovník, Universita Karlova, Praha 1996, ISBN 80-7184-164-1, s. 930

J. Horský, heslo: Revoluce hlav a srdcí, in: Velký sociologický slovník, Universita Karlova, Praha 1996, ISBN 80-7184-164-1, s. 931

J. Horský, heslo: Smysl dějin (českých) a duch doby, in: Velký sociologický slovník, Universita Karlova, Praha 1996, ISBN 80-7184-164-1, s. 1002-1003.

J. Horský, Peter Laslett:Verlorene Lebenswelten.Geschichte der vorindustriellen Gesllschaft.(překlad z angličtiny vyd. v řadě Kulturstudien bei Böhlau, 1988), in: Minulostí západočeského kraje XXVIII, 1992, Albis international Ústí nad Labem 1993, s.370-374, ISBN 80-900 838-03.

J. Horský, Bedrich Loewenstein:Der Entwurf der Moderne.Vom Geist der bürgerlichen Gesellschaft und Zivilisation. (Essen 1987), in: Minulostí západočeského kraje XXVIII, 1992, Albis international Ústí nad Labem 1993, s.374-377, ISBN 80-900 838-03.

J. Horský, Norbert Schindler, Widerspenstige Leute. Studien zur Volkskultur in der frühen Neuzeit, Frankfurt a. M. 1992, in: Minulost západočeského kraje XXIX, 1994, Albis international Ústí nad Labem 1994, s. 284-292, ISBN 80-900 838-54.

J. Horský, Rudolf Bultmann, Dějiny a eschatologie, Praha 1994, in: Minulost západočeského kraje XXX, Albis international Ústí nad Labem 1995, s. 250-255, ISBN 80-901 761-4-3.

J. Horský, Richard van Dülmen, Gesellschaft der Frühen Neuzeit. Kulturelles Handeln und sozialer Prozess, Wien - Köln - Weimar 1993, in: Minulost západočeského kraje XXX, Albis international Ústí nad Labem 1995, s. 292-304, ISBN 80-901 761-4-3.

J. Horský (Rec.): Lumír Dokoupil - Ludmila Fialová - Eduard Maur - Ludmila Nesládková, Přirozená měna obyvatelstva českých zemí v 17. a 18. století, Sociologický ústav AV ČR v Praze 1999, 142 stran; Český časopis historický 98, 2000, , s. 605-609, ISSN 0862-6111.

Jan Horský (rec.), Markus Cerman - Hermann Zeitlhofer (Hg.), Soziale Strukturen in Böhmen. Ein regionaler Vergleich von Wirtschaft und Gesellschaft in Gutsherrschaften, 16.-19. Jahrhundert, Wien - München 2002, stran 317, in: Historická demografie 26, vyd. Sociologický ústav AV ČR 2002, s.201-210, ISBN 80-7330-019-2, ISSN 0323-0937.